Primer Premier for Mac 6.24

Primer Premier Mac-ի համար. The Ultimate Primer Design Software ճշգրիտ PCR, Multiplex և SNP գենոտիպավորման համար

Եթե ​​դուք հետազոտող կամ գիտնական եք, որն աշխատում է մոլեկուլային կենսաբանության ոլորտում, գիտեք, թե որքան կարևոր է ունենալ ճշգրիտ և հուսալի այբբենարաններ ձեր փորձերի համար: Անկախ նրանից, թե դուք կատարում եք PCR ուժեղացում, մուլտիպլեքսավորում կամ SNP գենոտիպավորում, ձեր փորձի հաջողությունը կախված է ձեր պրայմերների որակից: Հենց այստեղ է գալիս Primer Premier-ը. այբբենարանի նախագծման հզոր ծրագիր, որն օգնում է ձեզ հեշտությամբ գտնել հնարավոր լավագույն այբբենարանները ձեր հաջորդականության համար:

Ի՞նչ է Primer Premier-ը:

Primer Premier-ը կրթական ծրագիր է, որը նախատեսված է օգնելու հետազոտողներին և գիտնականներին նախագծել օպտիմալ այբբենարաններ իրենց փորձերի համար: Այն օգտագործում է բարդ որոնման ալգորիթմ, որը գտնում է հալման առավել ճշգրիտ ջերմաստիճանը՝ օգտագործելով մոտակա հարևան թերմոդինամիկական ալգորիթմը: Ծրագրաշարը ցուցադրում է երկրորդական կառուցվածքների, դիմերների, վարսահարդարիչների, հոմոլոգիաների և ֆիզիկական հատկությունների այբբենարանները, նախքան դասակարգված կարգով լավագույնների մասին հաղորդումը:

Primer Premier-ի հարմար հաշվիչի ֆունկցիայի շնորհիվ օգտվողները կարող են հեշտությամբ մանիպուլացնել հաջորդականությունը և վերլուծել իրենց այբբենարանի դիզայնի արդյունքները: Ծրագիրը նաև թույլ է տալիս օգտատերերին բեռնել NCBI-ից հետաքրքրող գեները և ընտրել որոնման տիրույթ՝ հեշտացնելով հանգիստ նստել, մինչ Primer Premier-ն ընտրում է հնարավոր լավագույն այբբենարանները:

Ինչու՞ ընտրել Primer Premier-ը:

Կան մի քանի պատճառ, թե ինչու են հետազոտողները ընտրում Primer Premier-ը այլ այբբենարանի նախագծման ծրագրերի փոխարեն.

1) Ճշգրտություն. Իր առաջադեմ որոնման ալգորիթմով, որը հաշվի է առնում բազմաթիվ գործոններ, ինչպիսիք են հալման ջերմաստիճանը և երկրորդական կառուցվածքները, օգտվողները կարող են վստահ լինել, որ նրանք ստանում են բարձր ճշգրիտ արդյունքներ:

2) Արագություն. իր ինտուիտիվ ինտերֆեյսի և ավտոմատացված գործառույթների շնորհիվ, ինչպիսիք են երկրորդական կառուցվածքների և համասեռամոլների ցուցադրումը, օգտվողները կարող են խնայել ժամանակը՝ թույլ տալով Primer Premier-ին անել բոլոր ծանրությունները:

3) Ճկունություն. օգտատերերը լիովին վերահսկում են իրենց այբբենարանի ձևավորումները այնպիսի տարբերակներով, ինչպիսիք են գեների մեջ որոշակի շրջանների ընտրությունը կամ մուլտիպլեքսային անալիզների նախագծումը:

4) Աջակցություն. օգտատերերը կարող են ապավինել մեր թիմի հաճախորդների գերազանց աջակցությանը, ովքեր միշտ պատրաստ են օգնելու ցանկացած հարցի կամ խնդրի, որին կարող են հանդիպել մեր արտադրանքն օգտագործելիս:

Ինչպես է դա աշխատում?

Primer Premier-ի օգտագործումը պարզ է, պարզապես հետևեք հետևյալ քայլերին.

1) Բեռնել գեների հաջորդականությունը (ներ). Օգտագործողները կարող են բեռնել գեների հաջորդականությունները NCBI-ից ծրագրային ապահովման մեջ՝ պատճենելով/տեղադրելով դրանք նշանակված դաշտերում կամ վերբեռնելով FASTA ֆայլերը անմիջապես դրա մեջ:

2) Սահմանել պարամետրեր. Օգտագործողները սահմանում են այնպիսի պարամետրեր, ինչպիսիք են ամպլիկոնի չափի ցանկալի միջակայքը (նվազագույն/առավելագույն), հալման ջերմաստիճանի միջակայքը (նվազագույն/առավելագույն), GC պարունակության միջակայքը (նվազագույն/առավելագույն) և այլն՝ կախված իրենց փորձարարական կարիքներից:

3) Գործարկման վերլուծություն. Երբ պարամետրերը ճիշտ կարգավորվեն՝ օգտագործողի պահանջներին համապատասխան. կտտացրեք «Գործարկել վերլուծությունը» կոճակը, որը սկսում է ավտոմատացված գործընթաց, որտեղ Primier premier-ը որոնում է միլիոնավոր պոտենցիալ համակցությունների միջով մինչև օգտատիրոջ կողմից սահմանված չափանիշների հիման վրա PCR/multiplex/SNP գենոտիպավորման օպտիմալ պրիմիերներ գտնելը:

4) Վերլուծել արդյունքները և արտահանել տվյալները. օգտվողները ստանում են վարկանիշային ցուցակ(ներ)/աղյուսակ(ներ)/գրաֆիկ(ներ)/զեկույց(ներ); ցուցադրելով ամենաբարձր վարկանիշ ունեցող Պրայմերները՝ յուրաքանչյուրի մասին մանրամասն տեղեկությունների հետ միասին՝ ներառյալ Tm արժեքը. երկարությունը; GC բովանդակություն; առանձնահատկությունների միավոր և այլն, որն օգնում է նրանց տեղեկացված որոշումներ կայացնել այն մասին, թե որոնք են լավագույնս աշխատելու իրենց փորձերում:

Ո՞վ կարող է օգուտ քաղել այս ծրագրաշարը օգտագործելուց:

Primer premier-ը նախագծվել է, որպեսզի պահեն մոլեկուլային կենսաբանության լաբորատորիաներում աշխատող հետազոտողներին/գիտնականներին, ովքեր ձեռքի տակ ունեն բարձրորակ Պրայմերների կարիք՝ տարբեր տեսակի փորձեր իրականացնելիս, ինչպիսիք են PCR ուժեղացումը/մուլտիպլեքսավորումը/SNP գենոտիպավորումը և այլն։ բայց յուրաքանչյուր ոք, ով ցանկանում է ավելին իմանալ ԴՆԹ-ի հաջորդականության տեխնոլոգիայի մասին, կարող է նաև օգտվել այս կրթական գործիքից:

Եզրակացություն

Եզրափակելով; եթե դուք փնտրում եք արդյունավետ միջոց՝ օպտիմալ պրիմիերներ արագ ձևավորելու համար՝ առանց ճշգրտության խախտման, ապա մի նայեք Պրայմ Պրեմիեր-ից: Նրա առաջադեմ ալգորիթմները ապահովում են, որ միայն բարձրորակ թեկնածուները մտնեն ձեր ցուցակում, այնպես որ փորձարկման փուլում նույնպես կեղծ դրական/բացասականների մասին անհանգստանալու կարիք չկա: Գումարած, հաճախորդների գերազանց աջակցությամբ, որը հասանելի է 24/7 էլեկտրոնային փոստի/չաթի/զանգերի միջոցով, որոնք հասանելի են բոլոր ժամանակներում.