Նկարագրություն
Sequencher Mac-ի համար. ԴՆԹ-ի հաջորդականության վերլուծության վերջնական գործիք
Եթե դուք կյանքի գիտության հետազոտող եք, գիտեք, թե որքան կարևոր է ձեր տրամադրության տակ ունենալ ճիշտ գործիքներ: Իսկ երբ խոսքը վերաբերում է ԴՆԹ-ի հաջորդականության վերլուծությանը, չկա ավելի լավ գործիք, քան Sequencher-ը Mac-ի համար:
Sequencher-ը կրթական ծրագիր է, որն աշխատում է ԴՆԹ-ի բոլոր ավտոմատացված հաջորդականիչների հետ և լայնորեն հայտնի է իր կայծակնային արագությամբ համախմբմամբ, ուսուցման կարճ կորով, օգտագործողի համար հարմար խմբագրման գործիքներով և հիանալի տեխնիկական աջակցությամբ: Առաջին անգամ թողարկվել է գրեթե 15 տարի առաջ, Sequencher-ը դարձել է հաջորդականության վերլուծության առաջադրանքների հիմնական ծրագրակազմը գենոմային և դեղագործական բոլոր խոշոր ընկերություններում, ինչպես նաև բազմաթիվ ակադեմիական և պետական լաբորատորիաներում աշխարհի ավելի քան 40 երկրներում:
Բայց ի՞նչն է Sequencher-ին այդքան առանձնահատուկ դարձնում: Եկեք մանրամասն նայենք նրա հնարավորություններին:
De Novo Gene Sequencing
ԴՆԹ-ի հաջորդականության վերլուծության ամենատարածված կիրառություններից մեկը de novo գեների հաջորդականացումն է: Սա ներառում է ամբողջական գենի հավաքում զրոյից՝ հիմնված չմշակված հաջորդականության տվյալների վրա: Sequencher-ի միջոցով այս գործընթացը հեշտանում է շնորհիվ իր հզոր contig հավաքման ալգորիթմների, որոնք կարող են կարգավորել նույնիսկ ամենաբարդ հաջորդականությունները:
Մուտացիայի հայտնաբերում
ԴՆԹ-ի հաջորդականության վերլուծության մեկ այլ կարևոր կիրառություն մուտացիաների հայտնաբերումն է: Անկախ նրանից, թե դուք փնտրում եք հիվանդություն առաջացնող մուտացիաներ, թե փորձում եք բացահայտել գենետիկական տատանումները տարբեր պոպուլյացիաների միջև, Sequencher-ն առաջարկում է ձեզ իր առաջադեմ հետերոզիգոտների և SNP հայտնաբերման և վերլուծության հնարավորություններով:
Դատաբժշկական մարդու նույնականացում
Դատաբժշկական գիտության մեջ ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը վճռորոշ դեր է խաղում քրեական հետախուզության մեջ մարդկային մնացորդների կամ կասկածյալների նույնականացման գործում: Վստահության միավորների համար Sequencher-ի աջակցությամբ և GenBank-ի առանձնահատկությունների ներմուծմամբ՝ դատաբժշկական փորձագետները կարող են արագ վերլուծել մեծ քանակությամբ հաջորդականության տվյալները՝ պոտենցիալ համընկնումները բացահայտելու համար:
Համեմատական հաջորդականություն
Համեմատական հաջորդականությունը ներառում է երկու կամ ավելի հաջորդականությունների համեմատություն՝ նրանց միջև նմանություններն ու տարբերությունները բացահայտելու համար: Սա կարող է օգտակար լինել այնպիսի ոլորտներում, ինչպիսիք են էվոլյուցիոն կենսաբանությունը կամ դեղերի հայտնաբերման հետազոտությունը, որտեղ հետազոտողները պետք է համեմատեն գենետիկական հաջորդականությունները տարբեր տեսակների կամ շտամների միջև: Sequencher-ի համեմատական հաջորդականության հնարավորությունների շնորհիվ այս գործընթացը դառնում է շատ ավելի հեշտ և արդյունավետ:
Վստահության միավորների աջակցություն
Վստահության միավորները կարևոր չափիչ են, որն օգտագործվում է շատ հետազոտողների կողմից հաջորդականության տվյալները վերլուծելիս: Այս միավորները ցույց են տալիս, թե որքանով են նրանք վստահ, որ բազային զանգը կամ հավասարեցումը ճիշտ է տարբեր գործոնների հիման վրա, ինչպիսիք են որակի գնահատականները կամ ընթերցման խորությունը: Իր ալգորիթմների մեջ ներկառուցված վստահության միավորների աջակցությամբ՝ Sequnecer-ը հեշտացնում է մեծ քանակությամբ տվյալների վերլուծությունը՝ միաժամանակ պահպանելով բարձր ճշգրտության մակարդակ:
ORF Թարգմանություն
Բաց ընթերցման շրջանակները (ORFs) նուկլեոտիդների հատվածներ են գենի մեջ, որը կոդավորում է սպիտակուցները: Գենոմի ներսում ORF-ների նույնականացումը կարող է դժվար լինել, բայց Sequnecer-ի ORF թարգմանության հնարավորություններով հետազոտողները կարող են հեշտությամբ գտնել այդ շրջանները իրենց հաջորդականությունների մեջ՝ թույլ տալով նրանց ավելի լավ հասկանալ գեների գործառույթը:
GenBank Feature Import
GenBank-ի առանձնահատկությունները արժեքավոր տեղեկություններ են տալիս գեների մասին, ներառյալ դրանց գտնվելու վայրը քրոմոսոմներում, ինչպես նաև այլ ծանոթագրություններ, ինչպիսիք են էկզոնները/ինտրոնները և այլն: Ներմուծելով այս հատկանիշները Sequnecer-ում, օգտատերերը ստանում են լրացուցիչ տեղեկություններ իրենց հաջորդականությունների մասին, ինչը նրանց օգնում է ավելի տեղեկացված որոշումներ կայացնել ներքևում գտնվող վերլուծությունների ժամանակ, օրինակ՝ այբբենարան: դիզայն և այլն...
Սահմանափակման ֆերմենտների քարտեզագրում
Սահմանափակող ֆերմենտները կտրում են կրկնակի շղթա ԴՆԹ-ն հատուկ ճանաչման վայրերում՝ դրանք դարձնելով օգտակար գործիքներ գենոմի կառուցվածքի/ֆունկցիան ուսումնասիրելիս: Սահմանափակող ֆերմենտների տեղամասերը իրենց հաջորդականությունների վրա քարտեզագրելով՝ օգտագործելով Sequnecer, օգտվողները պատկերացում են ստանում գենոմների կառուցվածքային տատանումների մասին, որոնք կարող են օգնել ապագա փորձերի մասին, ինչպիսիք են PCR ուժեղացումը: և այլն..
Եզրակացություն:
Եզրափակելով, եթե դուք փնտրում եք կրթական ծրագրային գործիք, որը կօգնի պարզեցնել ձեր կենսաբանական հետազոտությունները, ապա մի նայեք ավելին, քան Sequnecer-ը: Նրա հզոր ալգորիթմները՝ համակցված օգտագործողի համար հարմար ինտերֆեյսի հետ, հեշտացնում են նույնիսկ սկսնակ օգտատերերին արագ սկսել աշխատանքը՝ միաժամանակ ապահովելով փորձառու հետազոտողների համար անհրաժեշտ առաջադեմ գործառույթները: Ուրեմն ինչո՞ւ սպասել: Ներբեռնեք ձեր պատճենն այսօր:
Ամբողջական բնութագիրը
| Հրատարակիչ | Gene Codes |
| Հրատարակիչների կայք | http://www.genecodes.com |
| Թողարկման ամսաթիվ | 2016-10-24 |
| Ավելացման ամսաթիվը | 2016-10-24 |
| Կատեգորիա | Կրթական ծրագրակազմ |
| Ենթակարգ | Գիտության ծրագրակազմ |
| Տարբերակ | 5.4.6 |
| OS պահանջները | Mac OS X 10.11, Mac OS X 10.9, Mac OS X 10.6, Mac OS X 10.10, Mac OS X 10.5, Mac OS X 10.7, Macintosh, Mac OS X 10.4, Mac OS X 10.3, Mac OS X 10.8 |
| Պահանջներ | None |
| Գինը | Free to try |
| Շաբաթական ներբեռնումներ | 1 |
| Ընդհանուր ներբեռնումներ | 1953 |
Comments: