GenoSuite
| Տարբերակ | 2.0.1 |
|---|---|
| Հրատարակիչ | Dhirendra Kumar |
| Թողարկման ամսաթիվ | 02 մյս, 2013 թ. |
| Ավելացման ամսաթիվը | 02 մյս, 2013 թ. |
| OS պահանջները | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Պահանջներ | None |
| Ընդհանուր ներբեռնումներ | 22 |
| Գինը | Free |
Նկարագրություն
GenoSuite-ը պրոտեոգենոմիկ վերլուծության համար մշակված շրջանակ է: FDRScore-ի վրա հիմնված ռազմավարությունն օգտագործվում է բազմաթիվ որոնման ալգորիթմների արդյունքները ինտեգրելու համար: Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) մշակվել է որպես GenoSuite շրջանակի մաս: PPT-ն պրոկարիոտային գենոմներում նոր թարգմանություններ գտնելու համար է և կախված է զանգվածային սպեկտրոմետրիայի վրա հիմնված պրոտեոմիկայի տվյալներից և հարակից գենոմի հաջորդականությունից: Առանձնահատկությունները ներառում են կազմաձևված 4 բաց կոդով ալգորիթմների համար՝ տվյալների բազայում պեպտիդների նույնականացման որոնում կատարելու համար, և 4 ալգորիթմի ցանկացած համակցություն կարելի է ընտրել, ցուցակագրել գենոմի որոնման հատուկ պեպտիդները (նոր պեպտիդներ), սպեկտրային համընկնումները կարող են պատկերացվել որակի գնահատման համար, ցուցակագրել: կարող են ստեղծվել նաև նոր սպիտակուցներ և առկա սպիտակուցային անոտացիաների փոփոխություններ, ինչպես նաև նոր պեպտիդների տեսողական գենոմային համատեքստ:
