MultiGeneBlast
| Տարբերակ | 1.1.5 |
|---|---|
| Հրատարակիչ | MultiGeneBlast |
| Թողարկման ամսաթիվ | 03 ապր, 2013 թ. |
| Ավելացման ամսաթիվը | 04 ապր, 2013 թ. |
| OS պահանջները | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Պահանջներ | None |
| Ընդհանուր ներբեռնումներ | 95 |
| Գինը | Free |
Նկարագրություն
MultiGeneBlast-ը բաց կոդով գործիք է, որը հիմնված է NCBI GenBank սպիտակուցային գրառումների FASTA վերնագրերի վերաֆորմատավորման վրա, որոնց միջոցով այն կարող է հետևել դրանց աղբյուրի նուկլեոտիդին և կոորդինատներին: MultiGeneBlast-ը կարող է օգնել սինթետիկ կենսաբանական նախագծերի համար նման բազմածին մասերի հայտնաբերմանը: Օպերոնների սինթետիկ գրադարանը կարող է ստեղծվել դրա արդյունքի հիման վրա՝ բացահայտելու այն օպերոնները, որոնց ֆունկցիան ամենամոտ է օգտագործողի կողմից ցանկալիին: Այս գործիքը հնարավորություն է տալիս նույնականացնել բոլոր հոմոլոգ գենոմային շրջանները՝ համատեղելով BlastP-ի մեկ գործարկումների արդյունքները յուրաքանչյուր գենի վրա և տեսակավորելով գենոմային շրջանները GenBank-ի ցանկացած մուտքից՝ ըստ հարվածների քանակի, սինթենիայի պահպանման և կուտակային Blast bit միավորի: Ճարտարապետական որոնումները կարող են իրականացվել՝ գտնելու ցանկացած գենոմային շրջաններ, որոնք ունեն Blast-ի հարվածներ ամինաթթուների հաջորդականությունների ցանկացած համակցության համար:
