| Տարբերակ | 4.5 |
|---|---|
| Հրատարակիչ | Bioinformatics Solutions |
| Թողարկման ամսաթիվ | 10 մյս, 2010 թ. |
| Ավելացման ամսաթիվը | 16 հլս, 2010 թ. |
| OS պահանջները | Windows XP/Vista/7 |
| Պահանջներ | None |
| Ընդհանուր ներբեռնումներ | 9 464 |
| Շաբաթական ներբեռնումներ | 9 |
| Գինը | Free |
Նկարագրություն
RAPTOR- ը նորարարական ծրագրակազմ է, որը նախատեսված է սպիտակուցների կառուցվածքի ճշգրիտ կանխատեսման համար: Այն համատեղում է վերլուծության առաջադեմ գործիքները մեկ ինտեգրված ծրագրային լուծման մեջ և ապահովում է երեք տարբեր թելման մեթոդներ: RAPTOR- ի ամբողջ թվային ծրագրավորման օպտիմալացման եզակի մոտեցումը առավել արդյունավետ է ցածր հաջորդականության հոմոլոգիա ունեցող թիրախների կառուցվածքային կաղապարներ գտնելու համար և ի վիճակի է առաջարկել բարձրորակ մոդելներ: Հեշտ օգտագործման ինտերֆեյսը և հասկանալի E արժեքները իդեալական են սկսնակների և մասնագետների համար: Ամենից առաջ արդյունքի ինտուիտիվ ցուցադրումը օգտվողներին հնարավորություն է տալիս պարզ հայացքից հասկանալ արդյունքները: Հաշվի առնելով թիրախային սպիտակուցի հաջորդականությունը, եթե կա հայտնի 3D կառուցվածքով համասեռ սպիտակուց, այն կարելի է գտնել ՝ օգտագործելով հաջորդականության որոնման գործիքներ, ինչպիսին է PSI-BLAST- ը, որը նույնպես տրամադրված է RAPTOR- ում: Թիրախի կառուցվածքն այնուհետև կառուցվում է հայտնի կառուցվածքից. սակայն, երբ հաջորդականության հոմոլոգիան էական չէ, այսինքն ՝ 25% -ից պակաս, PSI-BLAST- ը չի կարող վստահ հիթ ունենալ: Ի տարբերություն PSI-BLAST- ի, որն ուղղակիորեն կատարում է հաջորդականության որոնում, սպիտակուցի թելը, ծալքի ճանաչումը օգտագործում է ինչպես հոմոլոգիական, այնպես էլ կառուցվածքային տեղեկատվությունը: Այն սկանավորում է սպիտակուցների հաջորդականությունը անհայտ կառուցվածքով `հայտնի կառույցների տվյալների բազայի դեմ: Օգտագործելով միավորների գործառույթ և կատարելով համատեղելիության վերլուծություն եռաչափ կառուցվածքների և գծային սպիտակուցային հաջորդականությունների միջև, կբացահայտվի լավագույն կառուցվածքային ձևանմուշը, որից կարելի է կառուցել հաջորդականության կառուցվածքը: Արդյունքում, սպիտակուցային թելը ավելի բարձր կանխատեսում է տալիս, քան հոմոլոգիայի մոդելավորումը, երբ առկա է սահմանային հաջորդականության հոմոլոգիա:
